Ngày 01/4/1992, Tỉnh Ninh Thuận được tái lập và đi vào hoạt động. Ngày 11-8-1992, Chủ tịch UBND tỉnh Ninh Thuận ban hành Quyết định số 294/QĐ/UB-NT về việc thành lập Thanh tra Nhà nước tỉnh thuộc UBND tỉnh Ninh Thuận, có chức năng tham mưu giúp cho UBND tỉnh quản lý Nhà nước về lĩnh vực công tác thanh tra trên địa bàn tỉnh Ninh Thuận.

Trải qua 25 năm từ khi tái lập tỉnh, cán bộ công chức, người lao động ngành Thanh tra tỉnh qua các thời kỳ đã có những cống hiến cho sự nghiệp xây dựng và phát triển tỉnh nhà, đã được Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ tặng Cờ và Bằng khen; UBND tỉnh tặng Cờ thi đua đơn vị dẫn đầu Khối Nội Chính các năm liền. Đặc biệt, Ngành Thanh tra Ninh Thuận được Chủ tịch Nước tặng thưởng Huân chương Lao động hạng ba (năm 2008) và Huân chương Lao động hạng Nhì (năm 2012).